сторическая экспозиция музея раскрывает политическую и экономическую историю Троице-Сергиева монастыря XIV-XVII в. на подлинных материалах и муляжах. История архитектурного ансамбля Лавры представлена в архитектурной экспозиции. Макеты монастырского ансамбля наглядно демонстрируют этапы его формирования. Подлинные чертежи, схемы, архитектурные фрагменты рассказывают об уникальной реставрации памятников XV-XVII вв.

В последнее время музей уделяет большое внимание археологическим исследованиям и краеведению. Ежегодно проводятся археологические экспедиции и разведки на территории района. Интересный материал поступил в коллекцию музея с раскопок Кикинского городища и стоянок "Замостье-1" и "Замостье-2". В 1997 г. музей провел Международную археологическую конференцию "Каменный век Европейских равнин".
В открывшемся в сентябре 1998 г. краеведческом отделе музея представлена история города и района конца XIX-XX вв. Здесь регулярно проводятся выставки, посвященные памяти выдающихся деятелей науки, культуры, искусства, чья жизнь была связана с Сергиевым Посадом.

Коллекция изобразительного искусства XX в. начала формироваться в музее не так давно. Она состоит преимущественно из картин, этюдов, эскизов, оригинальной и тиражной графики художников Сергиева Посада, работ авторов, посвященных городу и его вечному символу Лавре (Юон, Кравченко, Осмеркин, Маврина). Многопрофильное собрание музея содержит в своем составе также редкий книжный и мемориальный фонды.