Сотрудники музея пытаются показать как известные, так и скрытые стороны афганской войны, которая стала одним из серьезных толчков к развалу СССР. Необъявленная война, которая длилась 9 лет, 1 месяц и 19 дней – самый масштабный военный конфликт после Великой Отечественной Войны с участием советских солдат. Выставка ставит одной из своих целей показать, что ставка на силу, как средство достижения политических целей, зачастую не оправдывает ожиданий.

Война эта имеет свои «белые пятна». В частности, об участии в ней спецслужб СССР долгое время умалчивалось, хотя КГБ играл активную роль на всех этапах афганской войны. В Афганистане было создано Представительство КГБ СССР. Сотрудники КГБ СССР являлись советниками при контрразведке, разведке, Следственном управлении органов госбезопасности Афганистана. Как правило, советники КГБ в открытых боях участия не принимали. Спецподразделения КГБ, кроме боевых задач, решали проблемы обучения сотрудников госбезопасности Афганистана, проводили переговоры с бандформированиями, оппозиционными группировками. Все эти направления находят отражение на выставке.

На выставке представлены уникальные фотодокументальные материалы, отражающие деятельность внешней разведки, контрразведки, спецподразделений КГБ, пограничников. Большой интерес представляют материалы по розыску и вызволению из плена советских солдат.

Посетители увидят повседневную одежду жителей основного племени Афганистана - пуштунов, а также первый вариант костюма бойца спецназа, плакаты моджахедов, листовки, журналы различных оппозиционных групп, подлинники уголовных дел по расследованию терактов в Афганистане, в числе которых взрывы у посольств СССР и Индии 28 сентября 1986 г. и 1 февраля 1987 гг.

Благодаря современным компьютерным технологиям посетители увидят фильм о пещерном комплексе «Тора-Бора», который советские спецподразделения «брали» еще в 1987 году, а в начале XXI века его существование связывали с именем Усамы бен Ладена.

Основу выставки составляют материалы Музея политической истории России и частных коллекций сотрудников ФСБ - участников Афганской войны.